Ο Σύλλογος Ε.Τ.Ε.Π. του ΕΚΠΑ είναι μέλος της Πανελλαδικής Ομοσπονδίας Ε.Τ.Ε.Π. των Ανωτάτων Εκπαιδευτικών Ιδρυμάτων της χώρας (ΠΟΕΤΕΠ ΑΕΙ).

Ανώτατο Όργανο της Π.Ο.ΕΤΕΠ είναι το Πανελλαδικό Συνέδριο (Π.Σ.), το οποίο παίρνει αποφάσεις για οποιοδήποτε θέμα του Κλάδου Ε.Τ.Ε.Π. και λειτουργίας της Ομοσπονδίας. Συγκροτείται από εκλεγμένους αντιπροσώπους των Συλλόγων μελών της Π.Ο.ΕΤΕΠ. Το πλήθος αντιπροσώπων κάθε Συλλόγου εξαρτάται από τον αριθμό των μελών του που συμμετέχουν στην εκλογική διαδικασία ανάδειξής τους (αναλογία 1 αντιπρόσωπος ανά 7 ψηφίσαντες).

Η Πανελλαδική Ομοσπονδία Ε.Τ.Ε.Π. διοικείται από εννεαμελές Διοικητικό Συμβούλιο (Δ.Σ.) που εκλέγεται με διετή θητεία από το Πανελλαδικό Συνέδριο.

Αντιπρόσωποι του Συλλόγου Ε.Τ.Ε.Π.-ΕΚΠΑ  στο Πανελλαδικό Συνέδριο της Π.Ο.ΕΤΕΠ  κατά την τρέχουσα περίοδο είναι (αλφαβητικά):

• Αυλωνίτης Βαγγέλης
• Βολουδάκη Ευαγγελία
• Ζήση Γεωργία
• Θωμάς Θεόδωρος
• Καραγιάννη Στέλλα
• Καραγκούνης Βαγγέλης
• Καραχρήστου Παναγιώτα
• Κόντου Ευτέρπη
• Κουνιά Σοφία
• Μελιγκώνης Βασίλης
• Πετροκόκκινος Λουκάς
• Σιαπέρας Λάμπρος
• Σωτηριάδου Μαρία
• Χαραλάμπους Παναγιώτα
• Χρυσάφη Βικτωρία

Στο Διοικητικό Συμβούλιο (Δ.Σ) Π.Ο.ΕΤΕΠ έχουν εκλεγεί:

• ΑΝΤΙΠΡΟΕΔΡΟΣ          Καραγκούνης Βαγγέλης
• ΜΕΛΟΣ   Δ.Σ.             Κουνιά Σοφία